147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4163 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.38 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.99 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  41.43 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.05 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  30.56 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  30.56 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.2 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  32.39 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.91 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  33.74 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  29.94 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.64 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.1 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  28.69 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  26 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.29 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.29 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.46 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.96 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.75 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.19 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.22 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.43 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  23.04 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.04 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  28.8 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  34.81 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  23.04 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.64 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  28.65 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  23.04 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  23.04 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.04 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  23.04 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  28.81 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.63 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22.61 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26.19 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.98 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  27.85 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.09 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.22 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  28.5 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  28.09 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.79 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  27.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  27.46 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.81 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.86 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.43 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.6 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.13 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  22.08 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  26.03 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.5 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  27.68 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.27 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.47 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  26.29 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.49 
 
 		 312 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.96 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.96 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  24.55 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.31 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  25.57 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.36 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  30.77 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  28.83 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  37.17 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  24.75 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  23.44 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.97 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.55 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  24.49 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  29.01 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  23.33 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.67 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.29 
 
 		 630 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  26.88 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  26.88 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  26.88 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>