97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0600 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  47.66 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  42.98 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.15 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  39.83 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  37.92 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  36.92 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  37.34 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  34.47 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  32.74 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  35.93 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  30.4 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25.54 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  25.54 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 268 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  31.72 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  34.38 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.56 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  32.47 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.06 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.59 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  32.41 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.77 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  28.97 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.75 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.76 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.57 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  26.24 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.37 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.81 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  30.99 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.42 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  28.35 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  34.81 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  27.37 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  30.68 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  27.7 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  29.79 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  25.74 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  25.45 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  29 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  29.21 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  29.21 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  29.21 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.88 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.04 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.59 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  27.72 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.85 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  33.77 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.88 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  29.89 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.94 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  30.39 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.42 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  31.41 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  32.2 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.28 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.63 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  29.09 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  27.22 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.97 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  28.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  29.56 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.65 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  27.4 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  26.59 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.96 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  28.8 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.66 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.09 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.87 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.05 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.74 
 
 		 273 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  24.18 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  27.67 
 
 		 280 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.37 
 
 		 314 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  28.93 
 
 		 281 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>