23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5503 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  65.55 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  53.56 
 
 		 316 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  54.08 
 
 		 304 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  35.35 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  35.07 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  32.37 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  30.32 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  22.5 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.65 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  23.98 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  22.91 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25.13 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  24.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.42 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.18 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  27.22 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  22.36 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.26 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  22.75 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0452  xylose isomerase domain-containing protein  24.51 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  25.57 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>