32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0995 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  75.66 
 
 		 316 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  54.08 
 
 		 301 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  53.79 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  37.88 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  35.22 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  35.13 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  31.65 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25.31 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  22.18 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  28.77 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  26.2 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  24.87 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  22.47 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  26.58 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  21.43 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  18.35 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  22.91 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  21.03 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  21.03 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.62 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.92 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.41 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  22.93 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  29.81 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  23.86 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.74 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>