31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2030 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  37.88 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  38.32 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  35.35 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  33.55 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  32.49 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  32.9 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.05 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  32.61 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  24.55 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  28.5 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.92 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  31.11 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  27.98 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.89 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.76 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2201  xylose isomerase domain-containing protein  29.7 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.12 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.86 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.88 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  32.2 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.17 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  28.64 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.73 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  28.86 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  32.93 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2682  xylose isomerase domain-containing protein  29.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>