38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0440 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 323 aa  634    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  35.71 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  35.92 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  35.22 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  35.07 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  34.52 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  32.49 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  29.5 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25.42 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  23.41 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  24.89 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.95 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.08 
 
 		 749 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.08 
 
 		 749 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.9 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  26.36 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  27.3 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.86 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  23.5 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  21.93 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25.48 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  23.83 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  28.32 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  24.4 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  23.01 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  25.3 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  22.59 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.47 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.52 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  22.38 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.75 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>