83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2972 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  59.84 
 
 		 257 aa  315  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  57.09 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  57.48 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.55 
 
 		 256 aa  288  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.76 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.55 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  38.43 
 
 		 257 aa  215  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  36.76 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.19 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  30.49 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.2 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.44 
 
 		 282 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  30.67 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  28.93 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.19 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.41 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  28.44 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.08 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  28.44 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  31.68 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  27.07 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.5 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.31 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  28.5 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.19 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.92 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.28 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  29.33 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.31 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  29.74 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  25.28 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.64 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.14 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  29.76 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.31 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.8 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.72 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.44 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  28.02 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.87 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  31.11 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.53 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.53 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.68 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.03 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.89 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  31.84 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  28.77 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.22 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  23.56 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  26.9 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  31.91 
 
 		 748 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.57 
 
 		 749 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  25.13 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.35 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2313  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 616 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  23.01 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.72 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.72 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30.91 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 762 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.3 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  26.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.17 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0988  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.37 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0393582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.85 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  23.78 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  25.71 
 
 		 270 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  25.95 
 
 		 247 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  25.86 
 
 		 272 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>