77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9139 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  80.67 
 
 		 272 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  68.94 
 
 		 294 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  65.54 
 
 		 305 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.43 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  68.06 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  69.62 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  60.38 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.02 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  55.77 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  56.65 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  55.04 
 
 		 263 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  52.88 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  52.88 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  52.88 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  51.44 
 
 		 281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  52.16 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.61 
 
 		 305 aa  281  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  53.12 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  50.54 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  51.18 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.06 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.64 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  53.05 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.64 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.7 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  48.66 
 
 		 325 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  48.88 
 
 		 278 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.88 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  46.72 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  45.53 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.52 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  26.2 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  27.09 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  26.47 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  29.76 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.24 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.54 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  24.17 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  24.17 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.17 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.97 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.17 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.17 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.4 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.17 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.44 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  24.17 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  22.56 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.95 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  26.36 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  27.91 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  26.15 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  19.55 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.49 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  32.39 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  26.72 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.67 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  21.46 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  24.89 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  24.67 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  39.24 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.14 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.55 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  32.56 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.21 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.66 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.72 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.46 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.05 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 255 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>