60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0407 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  85.32 
 
 		 302 aa  497  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  69.14 
 
 		 263 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  58.3 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  57.41 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  60.15 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  56.65 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.59 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  51.03 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.08 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.3 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  60 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.11 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.28 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.34 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  53.99 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  52.9 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.57 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  51.79 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  52.17 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  52.17 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  52.17 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  55.3 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  51.27 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.1 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  48.65 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.45 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.17 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  48.84 
 
 		 325 aa  244  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.49 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  50.78 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  29.72 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  26.24 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  23.24 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  23.24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  23.24 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  23.24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  23.24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  24.44 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.82 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.21 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  28.83 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  32.74 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.43 
 
 		 268 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.42 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3558  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.13 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  38.36 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  27.33 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>