53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0530 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  53.58 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  42.16 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  29.04 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  27.57 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  28.31 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  30.91 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.7 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  27.51 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.94 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.21 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  22.44 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  33.33 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.39 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.19 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  32.79 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  26.7 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  29.54 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.61 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  31.21 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  30.81 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  29.55 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.48 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.59 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.48 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.53 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  24.38 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25.13 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.75 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.95 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  25.13 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.26 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.21 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.56 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1934  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  27.6 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  28.78 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.17 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  30.99 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.27 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  33.05 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>