24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1279 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  41.58 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  41.39 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  40 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  32.23 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  29.3 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  29.84 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.36 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.28 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.89 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  34.44 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.54 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  20.88 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.21 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.75 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.6 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>