73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3010 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  47.04 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  43.82 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.16 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  32.47 
 
 		 269 aa  136  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 269 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  29.56 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  32.29 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.73 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  31.77 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  31.77 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  31.09 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  28.46 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.46 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.06 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  27.11 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  27.37 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  26.4 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  30 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  29.73 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.73 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  29.79 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.91 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.78 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  27.68 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  27.68 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  27.68 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.46 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.01 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.27 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  25.37 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.89 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  26.15 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.11 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  27.22 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  27.44 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.75 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.22 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.34 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  26.95 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  23.56 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  28.23 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  26.29 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1078  xylose isomerase domain-containing protein  31.31 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  21.34 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  21.34 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  24.86 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  20.49 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  29.71 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.43 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.56 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.75 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  31.52 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  31.52 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  31.52 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  20.49 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  20.49 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.49 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  20.49 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>