89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0247 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.78 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.06 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.88 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.95 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.5 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  32.84 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.88 
 
 		 257 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  30.37 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  31.19 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.34 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  30.77 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  35.09 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  31.37 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  31.38 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  33.33 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  32.57 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.73 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  21.4 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  32.1 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.67 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  29.11 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  29.95 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.74 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  22.27 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  26.2 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  23.83 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.47 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.4 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  28.29 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.5 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.96 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.87 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.79 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.48 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.38 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  29.96 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.73 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  26.9 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.65 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.01 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  29.53 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.95 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.18 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  26.24 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  26.24 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  26.24 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  26.61 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  22.83 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  20.31 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.51 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  20.66 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  23.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  20.77 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.38 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  34.13 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  25 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  26.22 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.18 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  27.38 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.24 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.13 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  26.26 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  30.19 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  28.8 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  26.26 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  20.83 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  26.26 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  26.26 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  26.26 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  28.4 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  36.25 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  26.48 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 316 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  37.84 
 
 		 308 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>