61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0023 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  36.76 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.06 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.34 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  34.58 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  32.94 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  32.4 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  32.81 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.4 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.57 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.27 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.29 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  30.42 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  28.79 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  24.73 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.93 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.6 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.2 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  32.57 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.62 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.19 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.43 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25.41 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  25.81 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.65 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.57 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  30.21 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25.51 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  30.77 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.32 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  26.7 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.95 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  27.53 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.71 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  29.36 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.73 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.01 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.12 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  34.15 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  29.5 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.81 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.78 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.05 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  23.95 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  24.71 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  25.6 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  29.86 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.14 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.55 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>