191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6413 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  64.84 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  63.28 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  64.45 
 
 		 263 aa  324  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  59.61 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  56.59 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.81 
 
 		 261 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.2 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  56.02 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  60.92 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  55.89 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  53.94 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.08 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  55.3 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  54.72 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  54.72 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  54.72 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  54.26 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  55.29 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  55.12 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.95 
 
 		 270 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.51 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  37.45 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  36.43 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  32.85 
 
 		 287 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  35.02 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  34.64 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  32.13 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  31.1 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.16 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  30.14 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  30.86 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  31.09 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  30.32 
 
 		 287 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  31.07 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  32.48 
 
 		 289 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  26.95 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  30.04 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.86 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  31.41 
 
 		 281 aa  98.6  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  30.71 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.9  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25.45 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.66 
 
 		 291 aa  95.5  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  29.03 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  29.7 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.09 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  29.32 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.25 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  29.32 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  29.32 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  27.1 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  27.64 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  25.95 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  28.31 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  25.44 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  28.78 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  29.35 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  28.9 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  27.31 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  28.47 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  28.27 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  29.48 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  28.3 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  28.36 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  27 
 
 		 304 aa  85.5  7e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  27.46 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  26.42 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  26.87 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  28.46 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  26.28 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  30 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  29.5 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  26.52 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  28.74 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  28.89 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  28.89 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  27.97 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  27.88 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  28.36 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  26.98 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  28.16 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  30.29 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  27.27 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  27.01 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  29.17 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  27.72 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  29.17 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  29.89 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  29.17 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  29.17 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  29.17 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  29.17 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>