189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0264 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  36.19 
 
 		 279 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  33.72 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  33.09 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  31.32 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  31.54 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  30.47 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  30.38 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  35.32 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  30.43 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  31.56 
 
 		 326 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  30.95 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  30.98 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  32.71 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  33.48 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  31.33 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  31.8 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  31.38 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  27.72 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  30.99 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  29.6 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  31.56 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  33.79 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  30.52 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  34.34 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  30.51 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  34.48 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  31.18 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  30.83 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  35.5 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  30.92 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  36 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  32.77 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  36 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  33.19 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.18 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  30.52 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  31.84 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  29.83 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  34.17 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  30.89 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  32.13 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  31.8 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  31.52 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  30.11 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  30.12 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  28.92 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  32.74 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  32.74 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  29.89 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  29.12 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  31.82 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.61 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  28.46 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  33.94 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  29.23 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  30.93 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  29.89 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  34.83 
 
 		 544 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  28.87 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  30.59 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  31.05 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  29.96 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  30.7 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  29.43 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  27.44 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  34.65 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  31.05 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  32.08 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  28.74 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  30.95 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  29.2 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  30.17 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  30.66 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  29.73 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  30.59 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  27.89 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  26.15 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  26.15 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  29.43 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  28.96 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  28.96 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  31.73 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  30.54 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30.69 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  30.69 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  30.73 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  28.96 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  28.96 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  28.96 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  30.69 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  29.22 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>