174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2857 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  67.88 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  65.82 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  64.34 
 
 		 277 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  64.84 
 
 		 277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  63.32 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  55.11 
 
 		 283 aa  308  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  47.37 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  47.02 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  45.07 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  44.24 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  46.01 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  46.01 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  43.87 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  45.63 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  46.01 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  45.63 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  45.63 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  45.63 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  45.63 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  45.25 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  40 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  40 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  39.44 
 
 		 300 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  38.35 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  42.09 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  41.3 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  47.44 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  35.97 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  38.55 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  36.92 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  38.71 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  39.62 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  36.79 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  38.41 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  36.82 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  34.77 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  35.23 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  36.2 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  37.26 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  34.88 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  37.4 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  35 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  37.5 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  36.2 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  35.5 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  37.64 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  36.92 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  37.86 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  35.21 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  33.59 
 
 		 379 aa  165  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  34.67 
 
 		 544 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  34.98 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  38.35 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  36.92 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  36.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  35.13 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  34.77 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  37.28 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  37.28 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  36.96 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  36.13 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  35.36 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  36.52 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  33.69 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  34.43 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  36.65 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  35.47 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  36.3 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  36.3 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  35.48 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  35.52 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  35.25 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  34.1 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  33.82 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  35.14 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  31.9 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  35.61 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  33.22 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  35.94 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  36.62 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  33.72 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  35.82 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  32.35 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  34.1 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  34.04 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  34.04 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  34.04 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  34.23 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  33.85 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  32.62 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  34.04 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  34.04 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>