174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0486 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  45.36 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  47.14 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  44.24 
 
 		 277 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  43.27 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  44.16 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  44.48 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  41.67 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  42.86 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  41.25 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  38.62 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  41.89 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  41.13 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  41.13 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  41.13 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  41.13 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  41.13 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  38.33 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  38.33 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  41.06 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  40.75 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  40.75 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  39.37 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  37.54 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  37.23 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  38.3 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  39.7 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.14 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  43.27 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  39.33 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  35.21 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  36.17 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  36.36 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  36.55 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  35.76 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  32.63 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  34.4 
 
 		 282 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  34.21 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  33.1 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  38.03 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  36.26 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  36.84 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  38.79 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  39.3 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  34.29 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  34.51 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  34.04 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  33.69 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  34.16 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  34.15 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  34.15 
 
 		 275 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  38.52 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  34.15 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  34.6 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  36.68 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  34.04 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  34.64 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.88 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  33.1 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  33.69 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  33.81 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  33.1 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  34.09 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  34.81 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  35.42 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  35.29 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  34.15 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  32.73 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  33.33 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  34.86 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  34.16 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  34.39 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  32.04 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  34.51 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  33.57 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  33.1 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  32.58 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  32.74 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  30.74 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  31.01 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  36.75 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.98 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  37.66 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  34.15 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  32.4 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  31.69 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  30.88 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  32.16 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  34.98 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  32.16 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  32.16 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  33.7 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  32.86 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  32.87 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  32.86 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>