172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07910 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  44.09 
 
 
286 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  42.39 
 
 
289 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  41.51 
 
 
276 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  44.74 
 
 
281 aa  237  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  44.36 
 
 
291 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  43.66 
 
 
283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  40.58 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  41.51 
 
 
276 aa  232  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  43.24 
 
 
282 aa  231  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  41.67 
 
 
293 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  39.64 
 
 
293 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  43.28 
 
 
279 aa  228  8e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  39.86 
 
 
286 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  41.09 
 
 
285 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  42.55 
 
 
283 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  40.94 
 
 
282 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  42.09 
 
 
283 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  41.22 
 
 
296 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  40.66 
 
 
283 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  39.57 
 
 
291 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  40.29 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  41.06 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  41.15 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  39.29 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  40.38 
 
 
292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  41.98 
 
 
283 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  39.21 
 
 
295 aa  209  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  38.6 
 
 
296 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  39.19 
 
 
281 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  38.91 
 
 
286 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  39.13 
 
 
284 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  41.98 
 
 
284 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  42.31 
 
 
283 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  41.13 
 
 
287 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  39.05 
 
 
290 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  37.68 
 
 
284 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  37.28 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  35.51 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  38.49 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  38.31 
 
 
279 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  37.45 
 
 
296 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  40.38 
 
 
287 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  40 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  39.77 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  38.78 
 
 
282 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  36.56 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  40.38 
 
 
281 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  36.2 
 
 
282 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.88 
 
 
328 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  38.1 
 
 
277 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 
282 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  39.19 
 
 
289 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  39.62 
 
 
286 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.18 
 
 
294 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  39.21 
 
 
282 aa  191  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  41.07 
 
 
281 aa  191  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  37.26 
 
 
379 aa  190  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  38.63 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  37.14 
 
 
287 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  39.48 
 
 
298 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  37.69 
 
 
277 aa  188  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  40.37 
 
 
296 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  40.37 
 
 
296 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  38.31 
 
 
275 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  39.16 
 
 
275 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  36.92 
 
 
277 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  39.16 
 
 
275 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  39.46 
 
 
282 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  37.69 
 
 
283 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  39.23 
 
 
285 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  39.23 
 
 
281 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  39.23 
 
 
285 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  39.23 
 
 
285 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  36.03 
 
 
283 aa  185  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  38.41 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  36.13 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  39.23 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  36.3 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  39.23 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  38.37 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  38.46 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  39.62 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  38.52 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  39.56 
 
 
463 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  37.28 
 
 
280 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  38.15 
 
 
299 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  36.93 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  39.92 
 
 
295 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  38.01 
 
 
281 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  37.4 
 
 
280 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  37.78 
 
 
296 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  38.57 
 
 
266 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  38.85 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  38.85 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  37 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  36.15 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  38.85 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  38.85 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  38.85 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>