174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1936 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  65.34 
 
 		 281 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  65.11 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  61.43 
 
 		 282 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  64.87 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  64.87 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  64.87 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  63.8 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  63.44 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  63.8 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  63.44 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  63.44 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  63.44 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  63.44 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  63.44 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  63.44 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  64.52 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  64.18 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  64.16 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  63.08 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  60.71 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  63.08 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  58.72 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  62.99 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  62.18 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  59.29 
 
 		 280 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  59.64 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  61.07 
 
 		 282 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  64.23 
 
 		 286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  60.71 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  63.31 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  60.71 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  60.71 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  61.09 
 
 		 281 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  60 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  60.28 
 
 		 284 aa  354  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  61.31 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  61.68 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  60.57 
 
 		 279 aa  349  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  59.64 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  59.14 
 
 		 283 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  56.32 
 
 		 292 aa  341  8e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  58.97 
 
 		 283 aa  341  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  58.01 
 
 		 284 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  57.04 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  57.04 
 
 		 289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  58.82 
 
 		 284 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  48.11 
 
 		 463 aa  270  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  48.65 
 
 		 379 aa  257  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  46.59 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  44.32 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  45.63 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  45.45 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  45.25 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  46.26 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  43.73 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  43.56 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  43.18 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  42.81 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  42.8 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  43.73 
 
 		 544 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  43.17 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  42.81 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  42.2 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  43.77 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  42.45 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  43.02 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  43.18 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  42.97 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  42.8 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  41.58 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  40.73 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  39.31 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  39.49 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  39.69 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  40.54 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  38.64 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  35.84 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  37.05 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  38.55 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  39.53 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  42.26 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  35.56 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  37.69 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  38.95 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  37.72 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  36.73 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  36.98 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  37.28 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  36.15 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  34.4 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  35.82 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.53 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.63 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  37.12 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  34.78 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  37.82 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  34.06 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>