180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0735 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  60.95 
 
 		 280 aa  345  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  56.46 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  53.62 
 
 		 277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  55.11 
 
 		 277 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  55.93 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  54.65 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  47.14 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  42.2 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  40.88 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  40.91 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  38.3 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  38.3 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  44.27 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  44.27 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  44.27 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  43.85 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  43.89 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  38.65 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  41.97 
 
 		 290 aa  208  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  38.19 
 
 		 300 aa  204  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  40.15 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  40.94 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  38.71 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  39 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  38.21 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  41.22 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  38.31 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  40 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  35.42 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  37.72 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  37.97 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  38.71 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  37.37 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  37.55 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  45.12 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  39.84 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  38.78 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  36.92 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  36.03 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  34.22 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  36.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  36.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  36.59 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  36.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  36.92 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  37.77 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  36.46 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  36.82 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  36.73 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  37.5 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  37.09 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  36.46 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  36.68 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  37.41 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  35.23 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  36.43 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  34.89 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  36.33 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  36.1 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  36.1 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  36.1 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  36.1 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  36.1 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  35.74 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  35.74 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  36.1 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  35.74 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.47 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  35.34 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  35.74 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.43 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  37.25 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  35.02 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.91 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.29 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  34.04 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  37.16 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  37.72 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  33.94 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  33.57 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  36.17 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  34.66 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  34.66 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  35.14 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  37.68 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  34.59 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>