189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0310 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  48.07 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  46.02 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  46.02 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  46.18 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  45.86 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  44.82 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  46.23 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  47.73 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  47.37 
 
 		 298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  47.37 
 
 		 298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  47.74 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  47.06 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  43.59 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  40.22 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  35.42 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  36.4 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  47.78 
 
 		 250 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  37.94 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  35.21 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  36.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  36.4 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  35.1 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  34.07 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  33.82 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  33.46 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  34.88 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  31.01 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  30.99 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  31.46 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  29.58 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  32.83 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  30.5 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  29.59 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  30.94 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  33.58 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  29.37 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  29.85 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  32.74 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  30.42 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  32.83 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  29.85 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  33.96 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  29.89 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  30.3 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  30.26 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  32.21 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  31.2 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  32.71 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  33.1 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  29.21 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  30.15 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  29.28 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  28.36 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  31.8 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  30.6 
 
 		 544 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  31.68 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  31.34 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  30.83 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  30.26 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  27.02 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  30.92 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  27.92 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  27.74 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  30.69 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  27.61 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  30.04 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  30.92 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  29.77 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  27.59 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  29.77 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  26.82 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  28.04 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  32.82 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  29.67 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  30.29 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  30.69 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  26.44 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  28.41 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  26.05 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  32.2 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  29.77 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  27.36 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  30.53 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  29.39 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  29.77 
 
 		 463 aa  125  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  27.65 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  29.24 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  29.39 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  30.37 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.3 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  29.39 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  26.98 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  29.39 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>