175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2675 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  100 
 
 		 285 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  98.95 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  98.95 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  86.69 
 
 		 279 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  81.79 
 
 		 281 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  80.94 
 
 		 283 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  81.07 
 
 		 281 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  80.94 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  82.01 
 
 		 288 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  80.94 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  81.29 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  81.29 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  81.29 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  81.29 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  80.58 
 
 		 285 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  80.58 
 
 		 285 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  80.94 
 
 		 285 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  79.5 
 
 		 285 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  79.5 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  79.5 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  79.5 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  79.14 
 
 		 285 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  79.08 
 
 		 285 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  68.93 
 
 		 282 aa  414  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  66.55 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  67.64 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  67.27 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  65.82 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  64.98 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  63.41 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  63.44 
 
 		 289 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  63.77 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  60.71 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  64 
 
 		 283 aa  358  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  60.64 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  61.82 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  59.64 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  61.31 
 
 		 284 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  59.57 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  58.84 
 
 		 284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  58.91 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  58.18 
 
 		 290 aa  327  9e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  58.48 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  55.23 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  55 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  55.96 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  55.96 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  47.1 
 
 		 379 aa  243  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  44.41 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  47.06 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  43.94 
 
 		 282 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  44 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  41.61 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  42.75 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  42.55 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  43.18 
 
 		 544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  43.94 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  44.32 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  41.84 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  38.71 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  42.11 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  42.09 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  41.22 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  41.29 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  41.83 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  41.44 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  39.93 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  41.44 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  38.57 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  39.38 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  37.07 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  39.15 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  41.15 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  37.83 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  40.08 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  38.2 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  37.69 
 
 		 283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  36.33 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.09 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  34.75 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  38.85 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  38.11 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  37.83 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  37.18 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  38.66 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  36.14 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  36.88 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  36.6 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  34.04 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.12 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  33.33 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  32.73 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  33.93 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  33.8 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  32.85 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>