175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0185 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  77.17 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  70.28 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  64.36 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  63.32 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  41.51 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  44.49 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  43.85 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  43.35 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  43.89 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  36.86 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  40.14 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  38.17 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  38.99 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  36.84 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  40.38 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  34.87 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  36.46 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.92 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  39.38 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  38.27 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  37.14 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  38.52 
 
 		 296 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  39.1 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  37.16 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  38.61 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  37.64 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  36.59 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  37.79 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  37.02 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  35.74 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.64 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  39.31 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  37.02 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  35.91 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.47 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  35 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  37.55 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  31.27 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  36.57 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  38.15 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.5 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  36.05 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  36.19 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  37.31 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  35.63 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  36.5 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  37.74 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  35.74 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  33.84 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  33.84 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  35.23 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  33.59 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 		 275 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  33.98 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.26 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  37.12 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  36.2 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  33.84 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  32.7 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  33.46 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  34.35 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  35.13 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  34.85 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  34.34 
 
 		 544 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  36.29 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  34.47 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  34.47 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  33.59 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  34.98 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  34.09 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  35.43 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  36.88 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  32.06 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  34.67 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  35.47 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  34.94 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  34.6 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  32.13 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  34.98 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  31.94 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  34.98 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  34.75 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  34.22 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  34.6 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>