181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl333 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  55.82 
 
 
289 aa  351  7e-96  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  48.46 
 
 
299 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  48.47 
 
 
296 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  48.47 
 
 
296 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  48.12 
 
 
298 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  45.76 
 
 
300 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  47.93 
 
 
298 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  46.44 
 
 
296 aa  255  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  45.86 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  45.86 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  45.24 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  45.52 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  45.52 
 
 
298 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  45.52 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  45.52 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  45.52 
 
 
298 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  44.56 
 
 
298 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  47.06 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  43.82 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  44.86 
 
 
250 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  33.92 
 
 
282 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  37.25 
 
 
283 aa  172  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  35.14 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 
277 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  31.9 
 
 
277 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  37.07 
 
 
283 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  31.52 
 
 
280 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  31.14 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  32.37 
 
 
277 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  30.88 
 
 
292 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.21 
 
 
287 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  32.36 
 
 
379 aa  149  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  35.78 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  34.62 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  32.74 
 
 
277 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  34.31 
 
 
293 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  33.95 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  34.11 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  33.91 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  34.88 
 
 
282 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  34.16 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  31.5 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  30.39 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  31.51 
 
 
286 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  33.91 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  33.33 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  30.91 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  32.47 
 
 
283 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  33.33 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  33.2 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  32.39 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  31.8 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.84 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  34.31 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  33.77 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  33.18 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  32.41 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  27.47 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  32.87 
 
 
289 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  30.94 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  31.91 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  30.6 
 
 
463 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  33.48 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  30.32 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  31.82 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  30.42 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  34.5 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  30.26 
 
 
282 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  31.16 
 
 
544 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  31.17 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  31.5 
 
 
295 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  31.94 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  31.1 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  28.08 
 
 
275 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  32.03 
 
 
279 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  31.16 
 
 
285 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  30.36 
 
 
291 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  28.08 
 
 
275 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  32.56 
 
 
285 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  31.63 
 
 
285 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  27.82 
 
 
285 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  27.82 
 
 
285 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  31.73 
 
 
278 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  31.16 
 
 
285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  29.52 
 
 
286 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  31.48 
 
 
279 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  27.74 
 
 
275 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  31.16 
 
 
285 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  29.64 
 
 
286 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30.7 
 
 
285 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.04 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  31.22 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  27.44 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  27.44 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  28.46 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  26.77 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  27.44 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  27.44 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  27.44 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>