176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1070 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 
284 aa  591  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  73.94 
 
 
286 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  73.24 
 
 
289 aa  447  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  73.84 
 
 
283 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  66.67 
 
 
285 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  66.67 
 
 
285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  66.67 
 
 
285 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  66.67 
 
 
285 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  66.67 
 
 
285 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  65.57 
 
 
285 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  65.2 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  65.2 
 
 
285 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  65.2 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  65.2 
 
 
285 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  65.57 
 
 
285 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  65.57 
 
 
285 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  65.57 
 
 
285 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  65.2 
 
 
285 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  63.18 
 
 
281 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  62.82 
 
 
281 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  63.87 
 
 
295 aa  361  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  62.77 
 
 
279 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  64.47 
 
 
285 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  63.5 
 
 
295 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  61.9 
 
 
288 aa  358  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  62.37 
 
 
286 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  62.64 
 
 
283 aa  358  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  60.79 
 
 
290 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  61.51 
 
 
282 aa  356  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  61.76 
 
 
283 aa  352  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  61.31 
 
 
285 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  60.79 
 
 
285 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  60.79 
 
 
285 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  60 
 
 
280 aa  345  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  60.29 
 
 
279 aa  344  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  59.27 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  61.37 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  59.64 
 
 
282 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  61.17 
 
 
284 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  58.82 
 
 
282 aa  335  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  57.82 
 
 
281 aa  332  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  56.68 
 
 
282 aa  332  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  57.76 
 
 
283 aa  330  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  57.4 
 
 
282 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  54.61 
 
 
292 aa  328  8e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  54.91 
 
 
280 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  49.28 
 
 
281 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  46.32 
 
 
463 aa  244  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  46.15 
 
 
379 aa  241  7e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  44.29 
 
 
296 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  43.06 
 
 
297 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  42.21 
 
 
544 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  40.57 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  41.33 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  40.07 
 
 
293 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  39.35 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  41.35 
 
 
326 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  41.49 
 
 
275 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  43.11 
 
 
282 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  41.49 
 
 
275 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  41.49 
 
 
275 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  41.89 
 
 
296 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  42.26 
 
 
282 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  42.97 
 
 
293 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  39.35 
 
 
285 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  40.23 
 
 
287 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  40.07 
 
 
280 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  40.96 
 
 
283 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  37.84 
 
 
283 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  40.23 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  39.25 
 
 
283 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  38.72 
 
 
283 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  37.41 
 
 
283 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  38.11 
 
 
281 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  37.07 
 
 
287 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  38.22 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  37.07 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  38.46 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  37.68 
 
 
283 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  37.79 
 
 
282 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 
292 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 
277 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  38.97 
 
 
294 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 
277 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  35.61 
 
 
280 aa  175  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  36.12 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  34.89 
 
 
282 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  36.26 
 
 
281 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  36 
 
 
277 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.91 
 
 
276 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  35.27 
 
 
291 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  35 
 
 
260 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  35.98 
 
 
282 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  37.97 
 
 
298 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 
277 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.36 
 
 
328 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  34.96 
 
 
296 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  34.96 
 
 
296 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  33.85 
 
 
296 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>