177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1738 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  38.43 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  38.87 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  38.27 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  38.77 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  37.23 
 
 		 328 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  36.56 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  36.33 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  37.05 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  34.62 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  36.3 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  34.77 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  36.13 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.74 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  35.32 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.69 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  34.47 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  35.11 
 
 		 296 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  37.72 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  33.22 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  32.14 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  34.19 
 
 		 544 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  33.58 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  34.16 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  33.83 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  33.81 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  34.53 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  34.64 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  33.97 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  32.3 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  30.74 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  32.85 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  33.95 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  32.06 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  31.16 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  31.94 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  30.8 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  29.96 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  30.38 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  34.84 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  33.09 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  34.67 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  34.07 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  32.13 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  32.49 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  33.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  32.82 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  29.89 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  33.83 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  31.06 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  33.76 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  31.58 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  32.46 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  30.5 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  32.98 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  31.32 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  32.98 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  31.03 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  29.89 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  34.45 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  30.77 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  31.44 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  31.68 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  30.91 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  28.62 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  31.82 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  30.34 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  31.72 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  31.72 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  30.86 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  30.97 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30.97 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  32.71 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  32.65 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  30.97 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  32.45 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  31.34 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  30.97 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>