187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2908 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  68.23 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  60.29 
 
 		 286 aa  341  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  57.4 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  59.42 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  54.06 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  52.3 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  52.31 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  50.18 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  49.3 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  37.14 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  40.29 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  38.41 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  37.2 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  38.35 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  38.46 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  37.41 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  38.13 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  37.41 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  36.98 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  38.03 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  39.72 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  38.38 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  32.38 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  36.79 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  35.71 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  39.18 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  37.08 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  37.26 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  35.92 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  37.68 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  39.32 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  31.16 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  37.91 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  30.77 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  32.16 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  33.81 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  36.14 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  35.85 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  34.16 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  36.16 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  34.35 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  35.93 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  33.81 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  38.72 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  31.87 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  34.41 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  35.31 
 
 		 463 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  35.21 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  35.77 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  35.69 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  37.08 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  35.77 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  36.82 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  36.82 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  36.46 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  35.11 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  35.38 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  33.97 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  36.82 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  36.82 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  35.98 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  34.35 
 
 		 281 aa  142  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.58 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  34.16 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  34.05 
 
 		 544 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  34.69 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  34.38 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  35.09 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  32.42 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  36.64 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  33.93 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  35.02 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.99 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.99 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  35.02 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  34.34 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  34.35 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  36.74 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  35.02 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  33.72 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  32.96 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  34.64 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  32.25 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  34.23 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  34.66 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  36.09 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  33.83 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>