173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3090 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  52.92 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  56.6 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  53.79 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  53.4 
 
 		 287 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  54.14 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  49.3 
 
 		 287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  50.34 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  50 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  50 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.93 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  36.49 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  32.75 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  35.54 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  37.06 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  33.8 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  33.92 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  33.33 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  33.57 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  32.75 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  33.33 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  36.36 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  33.22 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  37.19 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  34.78 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  35.86 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  33.09 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.91 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  33.92 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.85 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  34.27 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  33.68 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  31.41 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  33.22 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  33.82 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  30.77 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  30.26 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  34.74 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  32.17 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  36.3 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  32.36 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  30.28 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.26 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.26 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  28.87 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  31.8 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  32.52 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  32.63 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  33.45 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  30.42 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  32.35 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  32.63 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  33.09 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  28.67 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  32.29 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  32.61 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  32.29 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  32.29 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  32.29 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  32.29 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  32.73 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  30.95 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  31.58 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  32.29 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  32.76 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  31.94 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  31.94 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  33.56 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  29.59 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  31.94 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  31.93 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  31.94 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  31.93 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  30.74 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  33.45 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  35.07 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  32.06 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  31.58 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  31.58 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.06 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  31.58 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  32.94 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  32.3 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  32.98 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  31.75 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  30.66 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  30.15 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  31.58 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  32.63 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  32.98 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  30.53 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  30.56 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  31.38 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>