173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3254 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  92.63 
 
 		 287 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  60.84 
 
 		 296 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  57.04 
 
 		 286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  53.79 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  54.29 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  54.67 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  53.33 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  52.31 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  51.22 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  36.17 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  34.7 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  35.21 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.46 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  32.75 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  38.25 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  36.84 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  33.21 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  34.89 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  33.33 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  32.71 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  35.92 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  32.71 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  33.93 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  32.04 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  32.98 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  31.21 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  33.08 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  31.51 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  32.58 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  33.22 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  31.84 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  35.09 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  31.58 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  30.74 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  32.86 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  34.86 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  32.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  32.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  32.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  32.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  30.45 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  29.72 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  31.46 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  33.33 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  32.96 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  32.39 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  34.15 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  32.04 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  32.71 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  31.72 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  33.09 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.23 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  33.09 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  34.49 
 
 		 326 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  32.21 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  32.51 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  31.34 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  34.2 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  32.21 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  34.2 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  34.2 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  27.34 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  32.21 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  29.82 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  31.58 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  32.21 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  32.21 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  28.94 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  32.16 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  31.09 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  33.58 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  27.88 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  31.43 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  31.07 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  32.08 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  32.28 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  30.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  30.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  30.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  27.99 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  32.82 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  36.9 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  32.06 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  31.78 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  28.57 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  28.84 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  32.29 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  35.93 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  31.34 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  30.6 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.06 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  30.97 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  30.97 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  27.55 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>