185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1235 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 278 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  32.13 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  34.41 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  35.13 
 
 		 289 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  35.42 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  29.72 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  30.25 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  37.68 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  31.66 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  29.93 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  32.95 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  37.5 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  37.23 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  31.18 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  29.24 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  29.86 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  35.6 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  35.6 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  35.6 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  30.3 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  33.93 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  30.14 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  35.04 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  37.05 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.55 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.55 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  32.3 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  31.36 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  36.56 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  26.98 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  31.91 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  35.97 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  27.62 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  31.29 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  29.14 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  29.43 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  28.67 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  34.41 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.37 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.46 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  33.7 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  29.5 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  34.59 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  34.41 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  29.67 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  32.61 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  31.23 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  27.8 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  35.59 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  36.27 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  31.83 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  32.1 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  29.66 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.15 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  32.58 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  33.82 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  26.57 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  37.01 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  33.94 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  36.23 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  28.42 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  33.33 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  25.36 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  29.21 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  27.05 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  30.26 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  31.84 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  32.2 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  31.56 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  30.6 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  29.52 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  32.98 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  27.2 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  31.32 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  29.77 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  32.18 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  33.09 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.6 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.94 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.61 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  34.52 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  31.71 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  32.7 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  31.71 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>