183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4952 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  73.33 
 
 		 252 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  70.59 
 
 		 266 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  60.92 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  60.38 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  59.14 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  59.29 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  58.8 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  58.8 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  58.8 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  59.13 
 
 		 252 aa  294  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  62.6 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  57.54 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  56.7 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  61.3 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  59 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  58.1 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.94 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.1 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.49 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  50.57 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.77 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.69 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  37.55 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  34.28 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  35.31 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  33.84 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  35.14 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  32.5 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  30.66 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.79 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  34.15 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  31.21 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  29.93 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  31.97 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  31.18 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  33.09 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  31.73 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  30.22 
 
 		 283 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  28.18 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  26.64 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  27.88 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  29.3 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  26.71 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  28.73 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  30.5 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  29.23 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  32.14 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  28.87 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  28.05 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  28.4 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  27.68 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  28.14 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  27.54 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  28.05 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  27.66 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  31.3 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  29.63 
 
 		 276 aa  88.6  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  26.24 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  28.36 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  28.36 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  26.69 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  27.72 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  27.4 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  27.64 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  30.71 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  28.01 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  28.25 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  25.66 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  26.32 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  27.76 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  27.4 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.11 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  26.25 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  28.08 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  26.86 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  27.66 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  28.25 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  26.79 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  28.67 
 
 		 296 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.05 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  26.95 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  27.34 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  24.34 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  29.75 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  30.48 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  31.8 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  26.79 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  29.11 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  25.54 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  25.94 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>