202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73.33 
 
 		 256 aa  370  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  74.12 
 
 		 266 aa  357  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  63.92 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  61.26 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  61.07 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  63.92 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  59.61 
 
 		 258 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  62.35 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  58.23 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  58.73 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  57.43 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  57.43 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  57.43 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  56.63 
 
 		 250 aa  284  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  57.09 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  57.63 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.45 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.25 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.12 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  52.9 
 
 		 262 aa  261  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.8 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.08 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  34.48 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  34.11 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  34.09 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  33.46 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  35.04 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  34.8 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  35.5 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  31.94 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  33.69 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  31.94 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  34.95 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  31.11 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  31.91 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  32.25 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  32.31 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  31.68 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  32.05 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.5 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.3 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  31.2 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  31.46 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.96 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  32.82 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  29.59 
 
 		 299 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  26.57 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  31.15 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  28.46 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  30.64 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  30.52 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  32.04 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  32.04 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  29.89 
 
 		 286 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  30.37 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  29.15 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  29.86 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  29.15 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  29.15 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  30.12 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  28.78 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  31.09 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  31.76 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  29.15 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  29.91 
 
 		 295 aa  92  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  33.05 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  27.47 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  30.61 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  29.59 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  30.92 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  31.16 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  26.89 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  29.55 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  31.08 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  33.08 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  25.95 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  33.06 
 
 		 282 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25.66 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  29.72 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  31.36 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  27.7 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  28.06 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  30.43 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  28.78 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  30.22 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  27.86 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  30.19 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  30.18 
 
 		 277 aa  85.1  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  29.96 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  27.11 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>