189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7037 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  66.8 
 
 		 256 aa  347  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.31 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  63.28 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  68.75 
 
 		 257 aa  317  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  63.67 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  61.26 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  63.28 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.38 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  62.55 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.72 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  60.32 
 
 		 252 aa  291  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  59.52 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  59.52 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  59.52 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  58.82 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  59.52 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  58.33 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.38 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  55.3 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  54.72 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  52.65 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.89 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  37.5 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  36.5 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  37.82 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  36.26 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  37.05 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  34.25 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  35.04 
 
 		 283 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  31.68 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  32 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  32.63 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  34.57 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  32.86 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  30.14 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  33.74 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  29.29 
 
 		 286 aa  99  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.22 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  33.99 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  32.26 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  30.86 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.57 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  31.34 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  31.44 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  31.4 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  30.94 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  29.01 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  27.05 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  29.03 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  30.15 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  27.27 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  30.29 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  30.29 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  29.93 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  29.93 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  29.93 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  29.93 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  30.07 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  28.75 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.43 
 
 		 326 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  29.93 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  29.66 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  31.05 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  29.93 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  30.08 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  29.12 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  30.18 
 
 		 289 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  29.63 
 
 		 277 aa  85.1  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  29.43 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  29.09 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.67 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  29.56 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.82 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  29.52 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  31.05 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  29.09 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  29.2 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  29.79 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  31.05 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  29.69 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  25.38 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  30.69 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30.69 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  27.73 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  30.32 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  29.24 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  29.71 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  28.09 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  29.12 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  31.28 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  29.08 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  29.08 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  29.45 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  29.8 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  29.66 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  29.82 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>