188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4666 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.98 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  56.7 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  59.32 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.14 
 
 		 256 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  61.07 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  59.02 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  55.3 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  55.69 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  55.69 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  55.69 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  58.11 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  57.09 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  54.72 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  52.85 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  54.29 
 
 		 259 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.49 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  54.1 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  53.97 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  51.14 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.62 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.5 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.26 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  31.75 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  32 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  31.29 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  31.78 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  29.89 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  30.14 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  34.29 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  32.08 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  29.75 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  30.83 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  30.64 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  29.52 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  28.57 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  29.12 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.85 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.85 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  27.61 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  29.17 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  29.15 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  27.78 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  27.34 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.85 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  30.39 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  29.19 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  29.79 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  30.19 
 
 		 282 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  30.59 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  26.3 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  30.77 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  25.94 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  30.45 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.34 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  28.91 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  27.11 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  30.96 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  29.17 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  31.44 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  29.17 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  27.34 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  31.44 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  26.91 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  25.67 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  26.61 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  28.84 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  27.92 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  29.37 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  28.64 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  28.84 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  28.7 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  28.7 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  28.87 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  26.42 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  28.85 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  27.51 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  28.24 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  28.36 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  27.09 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  26.27 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  29.6 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  27.03 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  27.88 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  30.41 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  27.46 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  24.88 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.55 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  28.44 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  23.6 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  28.46 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  24.4 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  27.94 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>