176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  66.8 
 
 		 256 aa  347  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  63.92 
 
 		 252 aa  322  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.92 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.31 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  62.4 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  62.79 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  59.84 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  56.59 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.56 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  62.45 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.75 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.02 
 
 		 257 aa  281  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  55.78 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  55.78 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  55.78 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  55.34 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  54.72 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  54.9 
 
 		 252 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  57.52 
 
 		 260 aa  261  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  53.97 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  49.62 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.13 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  33.81 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.33 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  35.13 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  30.36 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  36.74 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  33.09 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  34.07 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.8 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.95 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  29.26 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  33.7 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  29.6 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  31.3 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.18 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  33.1 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  31.62 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  29.71 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  31.37 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  29.96 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  31.52 
 
 		 293 aa  92  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  28.94 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  28.73 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.38 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  28.06 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  32.79 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  30.55 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  30.71 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.72 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  30.55 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  31.37 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  31.45 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  28.78 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  30.34 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  23.86 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  34.54 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  28.62 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  29.82 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  27.14 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  32.26 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.47 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  29.45 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.95 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25.9 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.95 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  30.55 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  29.77 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.14 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  29.21 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  29.39 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  31.54 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  30.04 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  29.21 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  25.09 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  29.39 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  27.62 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  29.75 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  25.98 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  29.29 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  28.17 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  26.47 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  28.14 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  27.44 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  28.47 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  29.32 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  29.75 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  29.39 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  27.05 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  24.44 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  27.99 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  29.36 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  27.96 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  29.03 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  29.2 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  26.04 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>