188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3563 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  74.12 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  70.59 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  59.32 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  62.55 
 
 		 256 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  62.45 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  65.52 
 
 		 263 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  63.98 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  59.47 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  60.92 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  56.81 
 
 		 259 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.78 
 
 		 262 aa  284  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  59.29 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  56.92 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  56.92 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  56.92 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  56.69 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  55.69 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.77 
 
 		 261 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.87 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  53.79 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.46 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.2 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  35.79 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  36.59 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  34.72 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  34.23 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  33.84 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.45 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  36.33 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  32.73 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  32.25 
 
 		 289 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.39 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  33.33 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  30.61 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  32.98 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  33.64 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  33.56 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  32.43 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  31.02 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  29.35 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  29.75 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  30.66 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  30.66 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  30.66 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  30.66 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  32.28 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  30.91 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  30.29 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  31.02 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  31.02 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  31.02 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  31.33 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.56 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.56 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  30.8 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  30.25 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  31.25 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  30.74 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  30.18 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  29.02 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  28.11 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  33.2 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  29.79 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  31.65 
 
 		 250 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  29.96 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  32.56 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  30.62 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  30.34 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  29.3 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  33.1 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  29.32 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  27.99 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  30.98 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  31.43 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  29.46 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  25.83 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  28.25 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  30.98 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  30.11 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  29.89 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  29.46 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  28.32 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  29.45 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  29.34 
 
 		 295 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  29.75 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  29.23 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  29.15 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  29.24 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  25.09 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  29.5 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  29.75 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  28.57 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  31.18 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  29.1 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  30.2 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  24.07 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>