174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0436 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  77.34 
 
 		 257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  64.31 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  60.31 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  57.2 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  58.75 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  57.59 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  56.92 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.2 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  55.12 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  54.18 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  54.18 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  54.18 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  55.73 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.49 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  52.57 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  56.87 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  52.17 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.33 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  51.7 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  48.85 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  48.5 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.12 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  33.75 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  32.74 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.52 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.18 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  31.99 
 
 		 293 aa  101  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  30.83 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  28.63 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  30.91 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.71 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  31.32 
 
 		 287 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.19 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  30.6 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  30.04 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  30.56 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  26.64 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  29.06 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  29.81 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  28.9 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  30.8 
 
 		 284 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  29.66 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  31.08 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  30.18 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  28.26 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  29.12 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  29.66 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  27.96 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  27.17 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  28.14 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  28.73 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  27.41 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.84 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  28.87 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  26.41 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  27.05 
 
 		 296 aa  85.5  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.85 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  30.22 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  30.29 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  30.22 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  30.18 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  29.48 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  27.86 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  28.1 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  29.86 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.24 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.88 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  27.99 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  29.86 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  27.37 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  29.5 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  30.43 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  28.36 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  27.9 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  28.11 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.45 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  25.99 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  27.54 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  28.04 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  29.63 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  27.53 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  29.59 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  26.32 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  29.41 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  26.26 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  28.47 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  28.68 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  28 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  25.83 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  26.3 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  27.34 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.39 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.39 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  26.88 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  32.88 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  27.5 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>