186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0972 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  86.49 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  88.35 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  80 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.8 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  59.52 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  57.43 
 
 		 252 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  56.92 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  56.03 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.06 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  55.78 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  54.72 
 
 		 258 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  53.88 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.18 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  55.69 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  55.91 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  54.44 
 
 		 253 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  55.51 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.64 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.75 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.44 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  35.6 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  33.73 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  31.75 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  33.7 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.29 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  31.18 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  34.41 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  31.27 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.8 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  33.46 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  31.21 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  32.05 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.33 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  28.8 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  29.96 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.34 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  31.44 
 
 		 286 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  30.43 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  30.23 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  30.36 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  29.76 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  31.2 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.56 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  32.38 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  29.67 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  31.94 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  30.24 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  30 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  29.05 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  31.22 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  29.64 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  29.89 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  29.73 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  30.08 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  30.08 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  28.63 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  29.21 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  28.87 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  29.26 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  31.62 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  29.54 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  28.85 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  28.85 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  28.85 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.56 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  32.87 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  29.69 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  25.37 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  27.88 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  29.62 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  28.91 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  28.4 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  28.29 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  28.96 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  30.04 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  26.73 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  26.51 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  27.08 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  27.27 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  30.1 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  27.86 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.62 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  28.32 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  28.47 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  28.8 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  31.65 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  25.97 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>