183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4557 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  92.31 
 
 		 263 aa  454  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  64.45 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  63.67 
 
 		 256 aa  333  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  62.4 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.3 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  62.35 
 
 		 252 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  63.98 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.59 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  58.11 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.38 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  57.25 
 
 		 253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  55.43 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  57.59 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  56.65 
 
 		 262 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  55.86 
 
 		 250 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  55.51 
 
 		 268 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  55.51 
 
 		 268 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  55.51 
 
 		 268 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  55.51 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.3 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.35 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.63 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  34.32 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  33.07 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  35.9 
 
 		 293 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  33.73 
 
 		 279 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.45 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.82 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  33.08 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  32.27 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  30.94 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  33.57 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  31.18 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.92 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  30.6 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  28.2 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.3 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  29.73 
 
 		 296 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  26.06 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  31.54 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  31.27 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  29.47 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  25.54 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.01 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  30.57 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  30.77 
 
 		 294 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  26.41 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  26.88 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  26.62 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  27.31 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  29.21 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.15 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  28.95 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.96 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  27.21 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  27.97 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  28.16 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  30.34 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  30.42 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  25.45 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  29.77 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  27.54 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.42 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  27.14 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  29.5 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  27.34 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  27.34 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  30.42 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  26.26 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  28.62 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  25.99 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  26.39 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  26.39 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  25.84 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  29 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  27.59 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  26.49 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  29.91 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  27.45 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  26.73 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  28.47 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  29.06 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  28.78 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  28.52 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.41 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  28.11 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  28.67 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  28.41 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  28.9 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  28.9 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  26.87 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  28.79 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>