174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5069 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.29 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  63.56 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  61.38 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  60.41 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  55.95 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  61.6 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  61.75 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  56.8 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.33 
 
 		 256 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.69 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  58.43 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.79 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  54.62 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  51.47 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  51.44 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  51.44 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  51.44 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  49.62 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  52.31 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  50.2 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  49.79 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.01 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  33.81 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.58 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  32.95 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  33.71 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  34.35 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  33.21 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  34.92 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  30.57 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  34.5 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  33.22 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  31.6 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.51 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  32.53 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  33.92 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  32.13 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  25.56 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  27.69 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  35.25 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  27.7 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  30.77 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  32.58 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25.97 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  30.65 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  32.45 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  28.52 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  32.6 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  28.74 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  28.74 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  28.46 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  22.3 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  28.73 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  27.91 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  31.2 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  28.32 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  31.8 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  28.95 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  27.21 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  28.98 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  27.76 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  30.12 
 
 		 293 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  30.54 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  27.2 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  26.92 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  27.91 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  29.37 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  27.52 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  27.85 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  30.69 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  27.78 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  29.84 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  27.72 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  27.13 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  23.26 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  22.66 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  28.17 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  30.34 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  27.8 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  27.59 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  29.07 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  29.07 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  26.48 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  31.94 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  26.1 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  26.85 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  27.17 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  29.73 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  29.73 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  25.56 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  22.11 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  28.52 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  31.15 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  28.79 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  29.54 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  27.89 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  28.14 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>