176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0060 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0060  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5069  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.29 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.879949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  61.72 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  57.81 
 
 		 258 aa  301  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  57.63 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  58.24 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  59.45 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  60.16 
 
 		 263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.94 
 
 		 256 aa  281  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.2 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  59.38 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  59.77 
 
 		 266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  54.14 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  55.39 
 
 		 262 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  56.49 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.97 
 
 		 262 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  55.25 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.85 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  53.64 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  53.64 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  53.64 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  52.87 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  52.11 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  31.85 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  32.81 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  32.69 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  33.7 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.03 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  32.96 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  30 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  30.92 
 
 		 286 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  35.06 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  31.66 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  32.2 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  32.48 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  31.42 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  31.75 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  30 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  30.35 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  28.99 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  28.69 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  27.9 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  29.23 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  26.71 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  30.36 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  29.67 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  30.38 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  29.21 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  31.02 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  30.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  28.11 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  25.19 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  26.01 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  27.92 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  28.11 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  30.07 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  24.64 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  25.88 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  29.1 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  28.09 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  28.42 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  28.42 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  23.59 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  26.9 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  28.06 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  26.64 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  24.24 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  31.66 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  26.45 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.64 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  26.44 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  32.34 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  26.94 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  29.86 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  29.82 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  29.64 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  28.46 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  27.1 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  27.38 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  28.62 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  28.68 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  25.95 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  27.99 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  25.71 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.67 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  27.2 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  28.84 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  28.99 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  28.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  27.21 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  26.12 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  28.23 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>