31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2851 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  75.66 
 
 		 304 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  53.56 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  54.3 
 
 		 306 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  38.32 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  35.92 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  32.4 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  34.11 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.94 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  24.14 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  24.9 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  24.46 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  30.99 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  24.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  28.03 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.39 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.55 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  29.38 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  27.27 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  26.18 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  26.35 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  18.46 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  24.68 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  28 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  33.72 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  22.67 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.75 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  26.94 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.56 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.17 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>