259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2394 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  71.09 
 
 		 262 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  69.53 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.5 
 
 		 258 aa  353  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.73 
 
 		 265 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1197  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.32 
 
 		 259 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  61.24 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.69 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.75 
 
 		 264 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  57.59 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  57.14 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  56.76 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.43 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  31.27 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  30.33 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  32.13 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  43.7 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 312 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  30.63 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  31.89 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  31.54 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.8 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  28.12 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  29.01 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  31.69 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  35.1 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.55 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  37.68 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  28.14 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  31.95 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  32.07 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  28.52 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  30 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  24.71 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  29.75 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2533  xylose isomerase domain-containing protein  43.97 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.685925  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.81 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0113296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  41.75 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  30.73 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.63 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  30.99 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  32.76 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  28.24 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  39.64 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  35.67 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  28.41 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  41.53 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  28.06 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  30.45 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  28.06 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  39.8 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  28.06 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  28.06 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  37.08 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  28.06 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  37.86 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  32.61 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  29.53 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  29.28 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  35.88 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  44.68 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  26.82 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  27.67 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  25.61 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  28.68 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  28.97 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  28.97 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  33.78 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  29.32 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  30.22 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  34.06 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  28.52 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2687  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  28.52 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  28.52 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  34.53 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  38.83 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  40.7 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  33.58 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  39.42 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  34.38 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  37.86 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  37.86 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  32.43 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  37.86 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>