More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3371 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  88.67 
 
 		 256 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  37.13 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  38.98 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.45 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  35.51 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.4 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  33.98 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  34.68 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  30.92 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  32.14 
 
 		 260 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  33.98 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  31.73 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  31.73 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  33.21 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  30.4 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  32.13 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  31.6 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  32.4 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  30.4 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  31.62 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  31.6 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  30.8 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  33.06 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  33.08 
 
 		 271 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  31.37 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  31.45 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  31.75 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  32.8 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  31.6 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  31.92 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  33.6 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  32.16 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  30.38 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  31.13 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  33.72 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  29.13 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.67 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  29.76 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  33.86 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  31.37 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  30.94 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  33.92 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  29.5 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  30.28 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  34.29 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  32.06 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  27.31 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  30.86 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  30.86 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  30.86 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  26.91 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  28.4 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  30.62 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  30.62 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  31.98 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  34.34 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  29.43 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  29.92 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  29.43 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 312 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  34.52 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  37.13 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  25.59 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  26.17 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  31.42 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  28.51 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  28.51 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  28.34 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  31.06 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3899  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  28.05 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  27.17 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>