275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2851 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  63.04 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  46.12 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  46.33 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  47.33 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  42.25 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  41.67 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  44.57 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  44.88 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  46.36 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  46.36 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  41.73 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  46.36 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  41.73 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  41.73 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  39.92 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  41.34 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  46.46 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  44.92 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  41.9 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  45.31 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  44.14 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  42.47 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  43.87 
 
 		 260 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  41.73 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  41.9 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  43.87 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  41.27 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  43.08 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  41.96 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  42.97 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  42.69 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  40.71 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  38.74 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  40.08 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  39.68 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  41.18 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  41.18 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  40.48 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  41.18 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  38.74 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  44.31 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  41.27 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  42.29 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  41.57 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  41.5 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  41.67 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  38.34 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  41.18 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  41.11 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  39.92 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  40.71 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  43.53 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  37.3 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  41.63 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0246  Hydroxypyruvate isomerase  41.52 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  38.2 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  40.62 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  39.53 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  37.94 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  40.47 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.7 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  40.39 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  38.61 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  41.5 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  39.61 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  39.92 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0554  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.44 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>