More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4472 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.09 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  40.85 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  37.45 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.82 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  32.82 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.15 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  34.75 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  38.11 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  38.71 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  35.14 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  34.39 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  31.84 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  37.3 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  35.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  37.1 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  36.86 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.08 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  32.81 
 
 		 263 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  38.14 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.69 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  34.29 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  30.59 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  33.88 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  34.02 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  31.27 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  35.92 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  32.82 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  35.51 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  32.28 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  36.14 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  32.79 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  30.89 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.08 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  36.36 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  33.47 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  34.25 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  31.66 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  31.27 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  34.12 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  36.76 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  33.73 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  35.48 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  33.59 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  32.94 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  33.59 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  30.38 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  35.37 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  30.38 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  35.37 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  35.37 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  31.43 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  32.43 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  29.84 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  33.97 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  31.62 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  29.84 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  30.2 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  32.95 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1197  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.71 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  34.43 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  33.59 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  32.38 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  32.95 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  34.12 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  32.95 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  30.59 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  29.64 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  30.83 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.3 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  39.38 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  36.44 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.61 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  32.93 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  32.1 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  28.19 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  34.27 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  30.5 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  31.03 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  32.79 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  31.01 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  30.5 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  27.03 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  36.99 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  33.6 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  29.1 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  31.76 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>