254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31430 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  81.23 
 
 		 262 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  71.09 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.32 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.15 
 
 		 265 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.69 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1197  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.6 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.92 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  60.08 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  58.46 
 
 		 260 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  60.62 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  55.29 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.35 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.1 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  31.82 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  34.21 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  27.91 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  29.55 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  32.39 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  28.84 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  28.35 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  30.36 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  31.98 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  29.07 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  30.36 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  31.92 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  33.6 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  29.46 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  29.77 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  30.62 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  31.58 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  31.47 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  31.58 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  31.58 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2533  xylose isomerase domain-containing protein  46.72 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.685925  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  30.77 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  31.51 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  31.58 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.84 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  29.84 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  29.67 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  30.77 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  28.9 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  29.76 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  31.05 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  30.83 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  32.72 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  34.69 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  29.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  29.07 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  29.55 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.53 
 
 		 312 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  29.96 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  30.77 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  31.08 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2546  Hydroxypyruvate isomerase  29.45 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0308483  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  29.15 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  42.86 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  29.17 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  29.12 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  29.12 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  28.29 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  29.55 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  31.55 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  29.07 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  27.94 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  40.68 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  28.74 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  28.74 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  27.1 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  27.52 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  35.33 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  34.01 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  37.96 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  28.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1557  Hydroxypyruvate isomerase  29.8 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  29.46 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  28.46 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00433  Twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  31.17 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  29.07 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3036  hypothetical protein  28.34 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  31.79 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  28.34 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  28.34 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.82 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  29.65 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>