289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3457 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 
273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  44.15 
 
 
280 aa  221  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  46.33 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  39.77 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  42.52 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  40.71 
 
 
259 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  43.97 
 
 
263 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 
269 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  38.4 
 
 
263 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 
262 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 
262 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  42.13 
 
 
262 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 
271 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  39.69 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  38.95 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  38.95 
 
 
269 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  38.95 
 
 
269 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  40.23 
 
 
260 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  39.37 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  39.37 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  39.37 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  39.84 
 
 
260 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  39.23 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  38.98 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  40.86 
 
 
266 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  39.37 
 
 
269 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  40.86 
 
 
256 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 
260 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  41.09 
 
 
260 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  41.09 
 
 
267 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  39 
 
 
258 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  40.31 
 
 
260 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  39.85 
 
 
267 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  39 
 
 
258 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  39 
 
 
258 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  40.31 
 
 
260 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  39 
 
 
258 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  39.77 
 
 
260 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  35.19 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  38.52 
 
 
259 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  38.98 
 
 
262 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  37.8 
 
 
258 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  37.45 
 
 
262 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  38.67 
 
 
260 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  38.93 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  39.15 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  35.5 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  38.28 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  40.47 
 
 
259 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  38.19 
 
 
262 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  37.01 
 
 
262 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  36.4 
 
 
265 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  34.25 
 
 
258 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  37.11 
 
 
257 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  37.01 
 
 
262 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  36.22 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  36.72 
 
 
260 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  39.02 
 
 
260 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  35.83 
 
 
262 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  36.86 
 
 
259 aa  178  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  36.22 
 
 
260 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
269 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  35.55 
 
 
260 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  36.4 
 
 
265 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  39.3 
 
 
261 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  37.74 
 
 
257 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  35.94 
 
 
260 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  35.43 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  39.45 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  37.4 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  35.43 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  37.02 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  37.01 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  33.86 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  34.9 
 
 
264 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  39.3 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  38.82 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  38.26 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  31.89 
 
 
258 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  36.98 
 
 
266 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  35.2 
 
 
262 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>