269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4012 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  83.4 
 
 		 271 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  58.46 
 
 		 262 aa  298  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  58.53 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.77 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.7 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.63 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  57.14 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  55.81 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.33 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0057  xylose isomerase domain-containing protein  52.9 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1197  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.75 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  37.29 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3052  xylose isomerase domain-containing protein  32.92 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0431176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1301  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.02 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00429624  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  33.74 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  31.73 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  30.47 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  29.67 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  30.08 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  33.06 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  28.52 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  32.52 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.14 
 
 		 310 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0113296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  36.63 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  36.63 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  31.85 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  37.79 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  32.37 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2851  hydroxypyruvate isomerase  31.91 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000102215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  35 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  27.13 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  29.17 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1136  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.55 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  29.17 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  29.17 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  34.3 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  27.73 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  36.02 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  29.67 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  29.34 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  34.3 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  35.06 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  34.02 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  28.75 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  35.91 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  30.12 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  29.37 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  28.91 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  35.91 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  35.91 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  29.72 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  30.89 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  29.27 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  32.79 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  29.27 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  34.91 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  34.68 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  33.16 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  28.51 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  29.18 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  31.87 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  44.76 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  32.97 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  30.08 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  40.15 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  41.67 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  34.78 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  34.88 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  41.67 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  27.6 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  30 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  29.67 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  38.84 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  29.6 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  29.75 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  27.05 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  29.03 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.69 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  27.2 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  32.56 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  27.2 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  28.86 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>